Basic info
Gene IDRT1-A3
ChromsomeNC_051355.1
Start Position4847518
End Position4851344
Strand+
Annotation
NR tophit nameRT1 class I, locus A3 isoform X2
NR Tophit descripd__Eukaryota;k__Metazoa;p__Chordata;c__Mammalia;o__Rodentia;f__Muridae;g__Rattus;s__Rattus norvegicus
Swiss tophit namesp|P16391|HA12_RAT
Swiss Tophit descripRT1 class I histocompatibility antigen, AA alpha chain OS=Rattus norvegicus OX=10116 PE=1 SV=2
COG/KOG_
GOGO:0000003 GO:0001910 GO:0001912 GO:0001914 GO:0001916 GO:0002376 GO:0002474 GO:0002478 GO:0002483 GO:0002484 GO:0002485 GO:0002682 GO:0002684 GO:0002697 GO:0002699 GO:0002703 GO:0002705 GO:0002706 GO:0002708 GO:0002709 GO:0002711 GO:0002819 GO:0002821 GO:0002822 GO:0002824 GO:0003674 GO:0003823 GO:0005102 GO:0005488 GO:0005515 GO:0005575 GO:0005576 GO:0005615 GO:0005622 GO:0005623 GO:0005737 GO:0005783 GO:0005789 GO:0005794 GO:0005795 GO:0005797 GO:0005886 GO:0006950 GO:0006952 GO:0006955 GO:0007275 GO:0007399 GO:0007423 GO:0007565 GO:0007566 GO:0008150 GO:0009605 GO:0009607 GO:0009617 GO:0009897 GO:0009986 GO:0009987 GO:0010033 GO:0010721 GO:0010975 GO:0010977 GO:0012505 GO:0012506 GO:0016020 GO:0016021 GO:0019882 GO:0019883 GO:0019884 GO:0019885 GO:0022008 GO:0022414 GO:0030139 GO:0030154 GO:0030176 GO:0030659 GO:0030666 GO:0030670 GO:0030881 GO:0031090 GO:0031224 GO:0031227 GO:0031341 GO:0031343 GO:0031344 GO:0031345 GO:0031410 GO:0031982 GO:0031984 GO:0031985 GO:0032501 GO:0032502 GO:0032991 GO:0033218 GO:0034097 GO:0034341 GO:0042175 GO:0042221 GO:0042277 GO:0042590 GO:0042605 GO:0042608 GO:0042611 GO:0042612 GO:0042742 GO:0043207 GO:0043226 GO:0043227 GO:0043229 GO:0043231 GO:0043583 GO:0044421 GO:0044422 GO:0044424 GO:0044425 GO:0044431 GO:0044432 GO:0044433 GO:0044444 GO:0044446 GO:0044459 GO:0044464 GO:0044703 GO:0044706 GO:0044877 GO:0045087 GO:0045335 GO:0045595 GO:0045596 GO:0045664 GO:0045665 GO:0046977 GO:0046982 GO:0046983 GO:0048002 GO:0048513 GO:0048518 GO:0048519 GO:0048523 GO:0048583 GO:0048584 GO:0048699 GO:0048731 GO:0048839 GO:0048856 GO:0048869 GO:0050767 GO:0050768 GO:0050776 GO:0050778 GO:0050789 GO:0050793 GO:0050794 GO:0050896 GO:0051093 GO:0051128 GO:0051129 GO:0051239 GO:0051241 GO:0051704 GO:0051707 GO:0051716 GO:0051960 GO:0051961 GO:0060284 GO:0065007 GO:0070887 GO:0070971 GO:0071310 GO:0071345 GO:0071346 GO:0071556 GO:0071944 GO:0097708 GO:0098542 GO:0098552 GO:0098553 GO:0098588 GO:0098791 GO:0098796 GO:0098797 GO:0098805 GO:0098827 GO:0120035 GO:2000026
KOK06751
KEGG GENE NAMEMHC1
PfamPF00129.18
Synteny Block
Block ID Query Start Stop Query gap size Reference Start Stop Ref gap size
Block
Orthogroup
Jbrowse
Seqs
CDS
>RT1-A3
Protein
>RT1-A3